Недолго длилось спокойствие в Нью-Йорке, крупнейший мегаполис мира вновь стал центром криминальных разборок. На этот раз в игру вступает босс мафии, вместе со своими сподвижниками. Тем временем, четверо черепашек-ниндзя проходили уроки по рукопашному бою, в течение лет. Они стали настоящими мастерами спорта, и готовы встать на защиту любимого города. Донателло, Рафаэль, Леонардо и Микеланджело становятся единственными защитниками Нью-Йорка,